ภารกิจ และหน้าที่รับผิดชอบของหน่วยงาน

สำนักเลขาธิการมหาเถรสมาคม แบ่งออกเป็น 1 ฝ่าย 4 กลุ่ม 1 สถาบัน ดังนี้

        1. ฝ่ายบริหารทั่วไป มีหน้าที่ ดำเนินการบันทึกข้อมูล จัดทำเอกสาร ดูแลงานสารบรรณอิเล็กทรอนิกส์ รวมทั้งประสานงานกับส่วนราชการอื่นที่เกี่ยวข้อง

        2. กลุ่มงานในสมเด็จพระสังฆราช  มีหน้าที่ สนองงานตามพระบัญชาของสมเด็จพระสังฆราช งานพระกรณียกิจ ศาสนกิจของสมเด็จพระสังฆราชและพระราชาคณะ งานดูแลความเรียบร้อยและความปลอดภัยในการเสด็จพระดำเนิน

         3. กลุ่มงานมหาเถรสมาคม มีหน้าที่ สนองงานตามพระบัญชาและพระกรณียกิจของสมเด็จพระสังฆราช การบริหารของมหาเถรสมาคม และคณะกรรมการที่มหาเถรสมาคมแต่งตั้ง งานการประชุมมหาเถรสมาคม และแถลงการณ์คณะสงฆ์ งานกำกับติดตามมติมหาเถรสมาคม

        4. กลุ่มกิจการคณะสงฆ์  มีหน้าที่ งานพระสังฆาธิการ งานนิตยภัต งานทะเบียนประวัติ งานพระราชพิธี รัฐพิธี ศาสนพิธี และกิจการพิเศษอื่นๆ
        5. กลุ่มคุ้มครองพระพุทธศาสนา มีหน้าที่ งานเสนอแนวทางการกำหนดนโยบายและมาตรการในการคุ้มครองพระพุทธศาสนา งานดำเนินการและประสานงานกับคณะสงฆ์ในการลงนิคหกรรมและตรวจตราถวายคำแนะนำแก่พระภิกษุสามเณรที่มีอาจารไม่สมควรแก่สมณวิสัย และงานดำเนินการและประสานงานเกี่ยวกับการคุ้มครองพระพุทธศาสนา
        6. สถาบันพระสังฆาธิการ  มีหน้าที่  งานศึกษาและพัฒนาหลักสูตรการจัดการศึกษาคณะสงฆ์  งานบริการข้อมูลข่าวสารเกี่ยวกับความรู้ผลงานวิจัยและวิชาการทางพระพุทธศาสนาแด่พระสังฆาธิการ งานติดตามและประเมินผลและการศึกษาอบรมพระสังฆาธิการ และงานอาคารสถานที่และยานพาหนะ